Yılmazer'in görev yaptığı dönemlerde Ergenekon, Balyoz, OdaTV ve Selam Tevhid gibi kamuoyunda geniş yankı uyandıran soruşturma ve davalarda yer aldığı biliniyor. Eski emniyet müdürünün adı, ilerleyen yıllarda yasa dışı dinleme ve çeşitli kumpas iddialarına ilişkin hukuki süreçlerde de gündeme geldi.
Ali Fuat Yılmazer'in emniyet kariyerinin önemli bölümünde istihbarat birimlerinde görev yaptığı ifade ediliyor. Bir dönem İstanbul Emniyet Müdürlüğü İstihbarat Şube Müdürlüğü görevini yürüttüğü, daha sonra Emniyet İstihbarat Daire Başkanlığı C Şube Müdürlüğü görevinde bulunduğu biliniyor.
Yılmazer'in özellikle İstanbul'da görev yaptığı dönemde yürütülen bazı istihbarat faaliyetleri ve soruşturmalar nedeniyle kamuoyunda tanındığı belirtiliyor.
Yılmazer'in adı, Ergenekon, Balyoz, OdaTV ve Selam Tevhid soruşturmalarıyla bağlantılı olarak gündeme geldi. Söz konusu soruşturmalarda görev alan emniyet mensupları arasında yer aldığı ifade edilen Yılmazer hakkında, sonraki yıllarda çeşitli suçlamalar yöneltildi.
Yılmazer'in ayrıca FETÖ üyeliği ve bu yapılanmanın amaçları doğrultusunda hareket ederek bazı soruşturmalarda kumpas kurduğu iddialarıyla yargılandığı biliniyor.
Ali Fuat Yılmazer'in, 22 Temmuz 2014 tarihinde yasa dışı dinleme soruşturması kapsamında gerçekleştirilen operasyon kapsamında tutuklandığı belirtiliyor. Bu süreçte hakkında yasa dışı dinleme faaliyetleri ve çeşitli soruşturmalara ilişkin suçlamalar yöneltildi.
Ali Fuat Yılmazer'in, hakkında yürütülen çeşitli davalar ve verilen mahkeme kararları nedeniyle uzun süredir cezaevinde bulunduğu belirtiliyor. Yılmazer'in Silivri Cezaevi'nde hükümlü olarak bulunduğu bilgisi çeşitli kaynaklarda yer alıyor.
Eski emniyet müdürünün adı, özellikle emniyet istihbarat faaliyetleri, yasa dışı dinleme soruşturmaları, FETÖ davaları ve Hrant Dink cinayeti davası kapsamında gündeme gelmiş durumda.
