Kamu hizmetine 1994 yılında Erzurum Kaymakam Adayı olarak başlayan Aktaş, dil eğitimi için bir süre İngiltere’de kaldı. Ardından çeşitli ilçelerde kaymakam vekilliği yaptı.
Kariyerinde önemli görevler üstlenen Aktaş, sırasıyla 1997-1999 yıllarında Kastamonu'nun Devrekani ilçesinde, 1999-2001 yıllarında Bayburt'un Demirözü ilçesinde, 2001-2006 yıllarında Erzincan'ın Tercan ilçesinde ve 2006-2008 yıllarında Antalya'nın Finike ilçesinde kaymakamlık görevini yürüttü.
2008 yılında İçişleri Bakanlığı Mahalli İdareler Genel Müdürlüğü Şube Müdürlüğü’ne atanan Aktaş, burada geçici olarak Personel Genel Müdürlüğü Şube Müdürlüğü görevini de üstlendi. 2010 yılında Mahalli İdareler Genel Müdürlüğü Daire Başkanlığı'na atanan Aktaş, Ağustos 2013’te Personel Genel Müdürlüğü Daire Başkanlığı'na getirildi. 30 Aralık 2013’te İçişleri Bakanlığı Özel Kalem Müdürlüğü'ne atandı ve Ağustos 2014’te Personel Genel Müdür Yardımcısı olarak görev yaptı.
İlhami Aktaş, 30 Mayıs 2016'da Nevşehir Valisi olarak atanana kadar İçişleri Bakanlığı’ndaki görevine devam etti. 13 Haziran 2016 tarihinden itibaren Nevşehir Valisi olarak görevine başlayan Aktaş, 16 Haziran 2020’de görev süresinin sonlanmasının ardından 17 Haziran 2020’de Çanakkale Valisi olarak atandı ve 21 Temmuz 2024’e kadar bu görevde bulundu.
Cumhurbaşkanlığı kararnamesi ile 10 Temmuz 2024 tarihinde Kocaeli Valiliği’ne atanan İlhami Aktaş, 2024/207 sayılı kararname ile göreve başladı. Evli ve iki çocuk babası olan Aktaş, İngilizce bilmektedir. Kocaeli'deki yeni görevinde de başarılı bir hizmet süreci geçirmesi bekleniyor.
